El CESAVENAY opera Programas y Campañas Fitosanitarias para prevenir la introducción o dispersión de plagas que puedan afectar a los vegetales, sus productos y subproductos de la agricultura, así como para mejorar o conservar los estatus fitosanitarios en la producción agrícola. Mediante las campañas fitosanitarias se confina, controla y previene la dispersión de plagas. La vigilancia epidemiológica se realiza para detectar, determinar y actualizar, en forma permanente, el estatus fitosanitario de las plagas que han sido reguladas y las que representan una amenaza para la agricultura.
De igual modo se implementan programas fitosanitarios que apoyan a mejorar la competitividad de los cultivos a través de garantizar la calidad fitosanitaria de los productos vegetales, atendiendo las plagas reglamentadas que amenazan los cultivos de los Sistema-Producto.
Actualmente el CESAVENAY lleva a cabo los siguientes Programas y Campañas Fitosanitarias:
1.- Campaña Nacional Contra Moscas de la Fruta
2.- Campaña Contra Plagas Reglamentadas De Los Citricos
3.- Campaña Contra Plagas Reglamentadas del Aguacatero
4.- Campaña Contra Plagas del Cafeto
5.- Campaña Contra Moko del Plátano
6.- Programa de Vigilancia Epidemiológica Fitosanitaria
7.- Programa de Inocuidad Agrícola
8.- Proyecto Bienestar del Arroz
9.- Proyecto Bienestar del Frijol
10.- Proyecto Bienestar del Maíz